1. Industriële biotechnologie
- Productie van chiraal appelzuur (D- en L-vormen)
Hoogzuiver chiraal appelzuur wordt efficiënt en milieuvriendelijk geproduceerd door enzymatische resolutie van DL-appelzuur of microbiële transformatie.
- Verbetering van gewaseigenschappen
Genetische manipulatie wordt gebruikt om de expressie van MDH in planten te verhogen om de tolerantie voor zure grond, aluminiumtoxiciteit of zout-alkaliland te verbeteren.

2. Klinische diagnose
Serumbiomarker voor ziektediagnose
Verhoogde serum MDH-activiteit wordt in verband gebracht met verschillende ziekten, zoals leverziekten (bijv. virale hepatitis, leverkanker), acuut myocardinfarct en nierziekten.

3. Analyse en detectie
- Bepaling van het gehalte aan organische zuren in voedingsmiddelen (bijv. L-appelzuur)
Door gebruik te maken van de specifieke reactie die gekatalyseerd wordt door MDH, wordt enzymatische analyse (bijvoorbeeld het monitoren van de verandering van NADH bij 340 nm) gebruikt om nauwkeurig het appelzuurgehalte in monsters te bepalen, bijvoorbeeld bij wijnanalyse.
- Hulpmiddel enzym in wetenschappelijk onderzoek
Gebruikt als hulpmiddel bij fundamenteel onderzoek voor het bestuderen van metabolische routes, eiwitinteractie en enzymatische eigenschappen.

4. Doelwit voor ontwikkeling van geneesmiddelen
Potentieel therapeutisch doelwit voor verschillende ziekten
Studies hebben aangetoond dat MDH overgeëxpresseerd of functioneel abnormaal is bij verschillende vormen van kanker, stofwisselingsziekten, ziekten van het zenuwstelsel en parasitaire infecties, waardoor het een opkomend doelwit is voor de ontwikkeling van geneesmiddelen.