1. Indicateur acide-base : C'est son utilisation de base. Sa solution change de couleur entre un pH de 6,8 (rouge) et 8,0 (jaune). Il est couramment utilisé pour déterminer l'acidité ou l'alcalinité d'échantillons tels que l'eau et l'urine.

2. Évaluation et coloration de la viabilité cellulaire : Il s'agit de l'application biologique principale. Les cellules vivantes peuvent absorber le rouge neutre et le stocker dans les lysosomes acides (cellules animales) ou les vacuoles (cellules végétales), ce qui les colore en rouge ; les cellules mortes n'ont pas cette capacité et, en général, seul le noyau est légèrement coloré. C'est pourquoi il est largement utilisé dans :

- Test de cytotoxicité : Évaluer la toxicité des médicaments ou des produits chimiques en mesurant la quantité de colorant absorbée par les cellules vivantes.

- Observation de cellules vivantes : Utilisé pour la coloration vitale des cellules du sang périphérique ou d'autres tissus.

3. Coloration histologique : Utilisée comme coloration nucléaire ou contre-coloration dans la coloration des coupes de tissus (comme dans la coloration de Gram ou la coloration de Twort), faisant apparaître en rouge des structures telles que les noyaux cellulaires.

4. Coloration de structures cellulaires spécifiques : Peut être utilisée pour visualiser les corps de Nissl dans les cellules nerveuses animales et les structures dans les cellules végétales.

5. Indicateur d'hydrolyse des graisses : Dans les expériences histochimiques, il peut être utilisé pour indiquer le processus d'hydrolyse des graisses.

6. Identification microbienne : Ajouté à des milieux de culture tels que la gélose MacConkey, il est utilisé pour déterminer si les bactéries fermentent le lactose.

7. Préparation de bandelettes de test et détection analytique : Utilisé pour préparer des bandelettes de test au rouge neutre pour une détection pratique et rapide du pH. Il a également été utilisé pour la détermination photométrique des ions iodure, etc.